La finalidad de la REDMORA es establecer mecanismos para planear, regular, monitorear y manejar las reservas de agua de México y, en un futuro cercano, promover nuevas formas de manejo del agua adaptadas a las características socio-ambientales tanto de las cuencas que constituyen las reservas, como de aquellas que se encuentran bajo presiones antrópicas.

Diseñar y operar un sistema integral de planeación, investigación y monitoreo socio-ambiental para el manejo de seis de las reservas de agua en México.

1. Proponer un plan de manejo y sus reglamentos para las reservas de agua con base en las características particulares del estado socioambiental de cada reserva y de la disponibilidad de información.

2. Diseñar, implementar y promover ante la sociedad y los tomadores de decisiones un Sistema piloto de evaluación y monitoreo científico y comunitario de cada reserva de agua de acuerdo con la estructura actual y funcionalidad de sus cuencas, que favorezca su buen manejo basado en información científica.

3. Establecer un sistema de tecnologías de información y comunicación (TIC) para el trabajo conjunto y la difusión de los resultados de investigación y gestión con ayuda de la Red Mexicana de Cuencas, con una propuesta de formación de recursos humanos y de la sociedad en general, para el fortalecimiento de capacidades en cada reserva de agua.